L'allergologie moléculaire s'est imposée, ces dernières années, comme un outil de diagnostic, notamment pour l'interprétation des sensibilisations croisées et polysensibilisation. En effet, Ces différents problèmes ont pu être résolus par l'utilisation des IgE spéciques dirigées contre des allergènes moléculaires détectés soit d'une manière unitaire ou sous forme « multiplex » utilisant la technologie des biopuces. Deux possibilités de production existent : la purication des protéines naturelles et la synthèse sous forme de protéines recombinantes après clonage du gène correspondant et expression dans un vecteur. L'intérêt pratique des allergènes moléculaires dans l'interprétation d'une polysensibilisation cutanée et/ou biologique est particulièrement évident dans la pollinose. Leur utilisation combinée à celle d'IgE spéciques des recombinants d'allergènes majeurs des pollens permet d'appréhender certaines situations cliniques difficiles. Les protéines de transfert lipidique, isolées dans différents tissus de nombreux végétaux, sont considérées comme des panallergènes susceptibles d'expliquer une polysensibilisation. D'une manière générale, les symptômes cliniques sont de plus en plus sévères dans l'ordre des familles suivantes : crossreactive carbohydrate déterminants (CCD), prolines, PR-10, protéines de transfert des lipides (LTP) et protéines de stockage. La structure des protéines permet d'expliquer cette variabilité de réaction clinique. La détermination des prols allergéniques des patients permet également de mieux les phénotyper, d'approcher plus aisément l'implication clinique de leurs sensibilisations, et donc d'adapter au mieux les mesures d'éviction et la prise en charge thérapeutique.